No Colégio Marquês, o Ensino Fundamental II é a fase marcada pelo estímulo à criatividade. Para isso, neste nível de ensino, a instituição propõe ampliar o conhecimento e aprofundar os conteúdos adquiridos no nível anterior; aprimorar as capacidades de comunicação e de interação; consolidar o hábito de estudo e promover a iniciação em projetos científicos, artísticos e esportivos.